如何設(shè)置小泰勒蟲(chóng)qPCR的陰性對(duì)照
qPCR污染防控、結(jié)果判讀等相關(guān)背景知識(shí),小泰勒蟲(chóng)qPCR的陰性對(duì)照設(shè)置需嚴(yán)格遵循熒光定量PCR通用規(guī)范,同時(shí)適配小泰勒蟲(chóng)檢測(cè)的特異性需求,具體設(shè)置方法如下:
一、核心陰性對(duì)照類(lèi)型及設(shè)置要求
?無(wú)模板對(duì)照(NTC)?
?設(shè)置方式?:反應(yīng)體系中省略小泰勒蟲(chóng)DNA模板,其余組分(引物、探針、酶、緩沖液、無(wú)酶水)與樣本體系一致。
?作用?:監(jiān)測(cè)試劑、耗材、環(huán)境中的外源核酸污染,是所有qPCR實(shí)驗(yàn)的必設(shè)對(duì)照。
?判定標(biāo)準(zhǔn)?:正常情況下無(wú)擴(kuò)增曲線,若出現(xiàn)Ct值<35的陽(yáng)性信號(hào),直接判定體系存在污染。
?無(wú)逆轉(zhuǎn)錄酶對(duì)照(-RT對(duì)照)?
?設(shè)置方式?:僅在RT-qPCR檢測(cè)小泰勒蟲(chóng)RNA樣本時(shí)設(shè)置,逆轉(zhuǎn)錄步驟中不加入逆轉(zhuǎn)錄酶,其余后續(xù)qPCR體系與樣本一致。
?作用?:排除RNA提取過(guò)程中殘留的基因組DNA污染,避免假陽(yáng)性結(jié)果。
?近緣物種特異性陰性對(duì)照?
?設(shè)置方式?:使用與小泰勒蟲(chóng)同源性較高的牛巴貝斯蟲(chóng)、環(huán)形泰勒蟲(chóng)等近緣物種的核酸作為模板,其余體系一致。
?作用?:驗(yàn)證探針引物的特異性,避免交叉擴(kuò)增導(dǎo)致的假陽(yáng)性,適配小泰勒蟲(chóng)的物種檢測(cè)需求。
二、設(shè)置操作規(guī)范
所有陰性對(duì)照必須與待檢樣本在同一批次、同一反應(yīng)板上同步操作,不能單獨(dú)運(yùn)行。
陰性對(duì)照的加樣順序需優(yōu)先于待檢樣本,避免樣本核酸交叉污染陰性對(duì)照體系。
每96孔反應(yīng)板至少設(shè)置3個(gè)NTC對(duì)照,分布在反應(yīng)板的不同區(qū)域,全面監(jiān)測(cè)板內(nèi)污染情況。




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